1. Ilmu Agama Islam (IAI)
2. Ilmu Pengetahuan Alam (IPA)
3. Ilmu Pengetahuan Sosial (IPS)
Mulai tahun pelajaran 2007-2008 telah dibuka kelas husus dengan beberapa kehususan :
- Jumlah rombongan belajar maksimum 20 siswa
- Kemampuan kognitif siswa relatif homogen yang didasarkan atas hasil 2 tahap seleksi.
- Ada penambahan jam pada mata pelajaran Agama, Bahasa dan MIPA
- Berdasarkan keinginan siswa dan persetujuan orang tua.
- Di ruang kelas dilengkapi minimum 1 unit komputer.
- Pada tahap pertama akan diarahkan ke program Agama atau IPA.
Hingga tahun pelajaran 2009-2010 telah ada 6 rombongan belajar ; 2 di kelas X dan 2 di kelas XI IPA, dan 2 di kelas XII IPA.